Ieronim nasce l’8 marzo 1888 nel villaggio Kriviči, governatorato di Vilno. Studia prima al seminario di Žitomir e poi all’Accademia teologica di Pietroburgo. Viene ordinato sacerdote di rito latino nel 1914. Nel 1915 è parroco nel villaggio Šacilki. Nel 1917 viene mandato ad esercitare il ministero in Siberia. Inizialmente è parroco a Tomsk. Nel 1922 è parroco a Barabinskoe.
Nel dicembre 1929 viene arrestato a Tomsk e condannato a 6 mesi di prigione. Dal 1930 esercita il ministero nella parrocchie di Krasnojarsk e Irkutsk (dal 1925, come parroco di Krasnojarsk, prima che le autorità gli vietassero di lasciare la città, gli erano state affidate anche le parrocchie di Tomsk, Kamensk, Ačinsk e quella di Novosokol’sk). Nel 1931 viene arrestato e imprigionato per breve tempo. Il 25 febbraio 1932 padre Ieronim scrive una lettera di ringraziamento all’ambasciata polacca per l’aiuto ricevuto dalla Croce Rossa polacca (150 rubli). La lettera cade nelle mani della polizia politica (NKVD), e il 2 giugno 1935 il sacerdote viene arrestato, assieme ad altri polacchi, con l’accusa di aver creato «un gruppo di spionaggio controrivoluzionario a favore della Polonia». Il 31 marzo 1936 viene trasferito nella prigione di Novosibirsk e il 24 giugno 1936 è condannato a 10 anni di reclusione che sconta nella prigione di Krasnojark. Nel 1937 viene coinvolto nell’inchiesta collettiva del «centro siberiano dell’armata insurrezionale polacca (POV)», e accusato «di aver tenuto contatti per lunghi anni con lo Stato maggiore generale polacco e con il Vaticano, di aver svolto attività insurrezionale e nazionalistica fra i coloni polacchi in Siberia … di aver trasmesso, tramite diplomatici stranieri, notizie sulla persecuzione da parte del governo sovietico contro la religione, accusandolo di aver chiuso chiese cattoliche, di aver arrestato sacerdoti, di aver usato misure repressive contro i cattolici e di aver costretto i contadini alla collettivizzazione».
Il 4 gennaio 1938 padre Ieronim Cerpenko viene condannato alla pena capitale e il 18 gennaio 1938 è fucilato nella prigione di Krasnojarsk.